1、治疗的难度及时间不同
普通肺结核一般经6-8个月规律的抗结核治疗，80%以上的患者可以获得痊愈；而耐多药肺结核则至少需要24个月的抗结核治疗，重者甚至形成36个月的治疗，且治愈率仅仅有50%-60%。
2、治疗的药物不同
普通肺结核一般使用一线抗结核药物治疗，其治疗的副作用相对较少，患者容易耐受；而耐多药肺结核则必须启用二线抗结核药物治疗，其治疗的副作用往往较多、较大，患者不容易耐受。
3、治疗的花费不同
普通肺结核患者整个疗程的治疗费用一般为几百元，而耐多药肺结核整个疗程的治疗费用一般是普通肺结核倍以上；如果耐药患者出现其他的合并症，治疗费用将会更高。
4、对社会的影响不同
普通肺结核患者一般在治疗后1个月左右，其痰内不再排结核菌，传染性消失；而耐多药肺结核由于治疗比较困难，其传染期更长，容易传染更多健康人。而且受到耐多药肺结核患者传染的人，一旦发病就是耐多药肺结核患者，其治疗较普通患者困难较多。
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