GenotypicandspatialanalysisofMycobacteriumtuberculosistransmissioninahigh-incidenceurbansetting
基因分型技术可以帮助我们了解结核病的动态传播。具有相同结核分枝杆菌DNA指纹图谱的患者通常是由近期传播导致，而那些具有独特指纹图谱的患者更可能是由于内源性复燃。目前许多国家开展了基于人群的分子流行病学研究，但是在全球22个结核病高负担国家中上述研究较少开展。巴西卫生部自年开始，在全国范围内开展了以家庭为单位的结核病防治项目。据世界卫生组织报道，巴西每年新发结核病发病率为46/10万。维多利亚是圣埃斯皮里图省省会，该地区结核病发病率约为51/10万，高于全国平均水平，这可能与该地区的结核病患者诊断延迟和密切接触者调查不足有关。为了了解该地区结核病传播模式，本文章作者联合结核分枝杆菌基因分型数据和患者居住地空间分析，探索年-年维多利亚地区结核病传播模式及影响传播的风险因素。
自年1月到年12月，维多利亚地区总共报告名结核病患者，其中分离得到株结核分枝杆菌菌株纳入本研究。通过RFLP分型，共发现70个簇（具有两株及以上相同基因型菌株），其中包括4个大簇（包括9株及以上相同基因型菌株），当地新登记结核病患者中有34%（/）是由于近期传播造成，同时有5.7%（29/）的患者是由于家庭密切接触造成。进一步对成簇菌株进行空间分布分析，如下图A所示，由于近期传播患者主要分布于该地区的西部、中部和西南部（发白色部分），而该地区恰具有多项结核病风险因素，包括低收入，贫民区和人口密度高。以非成簇菌株为对照，采用传统贝叶斯对成簇菌株进行分析结果如B所示，该地区结核病传播的风险较高的地区（红色或橙色部分）和图A分析结果具有高度一致性。进一步分析4个大簇所含菌株，我们发现，与非成簇对照菌株相比，成簇菌株的空间距离明显短于非成簇菌株（P0.05）。
上述结果通过结合空间地理信息和结核分枝杆菌基因分型信息，确认了巴西维多利亚地区结核病近期传播风险最高的三个区域，成簇菌株分布相对集中，而非成簇菌株呈现随机分布特点。该研究结果提示我们将地理信息和基因分型数据结合可以为结核病高负担国家和地区提供一种更有针对性的患者发现策略，通过确认近期传播高风险地区并在上述地区开展患者发现工作，将更高效地发现由于近期传播导致的结核病患者。
PMCID:PMC
翻译：逄宇中国疾病预防控制中心
校对：医院
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