现有的结核诊断方法存在诸多不足。临床症状和影像学特征有助于疑似患者的发现，但进一步诊断需要结合实验室检测。结核现有早期诊断手段有涂片镜检和分子检测等方法。结核菌分离培养是目前结核诊断的金标准，不仅具有较高的检出率，且能对菌种进行鉴定，但耗时较长（一般需培养6-8周），不能做出早期诊断。
诊断肺结核主要依靠病原学依据，如痰里找到结核菌，或者支气管镜检查活检找到结核菌等，实际上痰里找到结核菌的阳性率很低，对于一些有典型结核中毒症状，胸片或CT很典型的结核表现，又有血沉增快，PPD皮试强阳性，结核抗体阳性，结核斑点试验阳性等检查基本可以诊断结核，并且开始诊断性抗结核治疗。
此外还要注意肺结核与肺癌的诊断，肺结核因为结核杆菌引起的慢性肺部感染而引发的，而肺癌是由于肺部细胞受到外界的刺激癌变而引发造成的。肺结核治疗主要是药物治疗，药物治疗的主要作用在于缩短传染期、降低死亡率、感染率及患病率。
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